Динамика частоты встречамости уропатогенов и антимикробных детерминант резистентности при детской значимой бактериурии в 2017 и 2019 годах: моноцентровое исследование

Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) являются вторыми по частоте встречаемости инфекциями у детей, в то время как распространение среди уропатогенов антимикробной резистентности представляет в настоящее время высокую эпидемиологическую угрозу.

Цель. Провести анализ видового состава и наличия генетических детерминант антибиотикорезистентности.

Материалы и методы. В ходе исследования был проведен ретроспективный анализ 215 образец средней порций мочи. Образцы были получены в течение 2017 и 2019 годов от пациентов в возрасте от 4 недель до 17 лет в ФГАУ «Национальный медицинский исследовательский Центр Здоровья Детей» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Результаты. Видовая принадлежность патогенов была установлена в 93 образцах, в то время как бактериальный состав других образцов был классифицирован как «кишечная флора» (n = 17), «кокковая флора» (n = 16) или «смешанная флора» (n = 89). Наиболее распространенными видам уропатогенов при монопатогенных инфекциях в 2017 и 2019 являлась Escherichia coli (37,5% и 29,2%, соответственно). Среди инфекций, вызванных множественными патогенами, наиболее часто встречающимися этиологическими агентами являлись Pseudomonas aeruginosa и Staphylococcus spp. Среди всех исследованных образцов 31,9% содержали CTX-M-подобные гены, 5% гены VIM, 1,8% гены NDM, а также 3,0 % — OXA-48-подобные гены, а также 5,6% образцов содержали две и более генетические детерминанты, ассоциированные с резистентностью, при этом наиболее превалирующей комбинацией генов было сочетание CTX-M- и OXA-48-подобных генов. В 69 образцах с идентифицированными видами уропатогенов профиль устойчивости к противомикробным препаратам, определенный микробиологическими методами, соответствовал обнаруженным генам устойчивости.

Выводы. Авторы полагают, что введение в общую клиническую практику тестирования на наличие генов, ассоциированных с антибактериальной резистентностью, предоставит не только возможность проведения эпидемиологического мониторинга за генетическими детерминантнами антибиотикоустойчивости, но также предоставит возможность подбирать корректное своевременное лечение детских бактериурий, вызванных антибиотикорезистентными инфекционными агентами.

1. Simões e Silva A.C., Oliveira E.A., Mak R.H. Urinary tract infection in pediatrics: an overview. J Pediatr (Rio J). 2020;96:65—79. DOI: 10.1016/j.jped.2019.10.006.

2. Shaikh N., Morone N.E., Bost J.E., Farrell M.H. Prevalence of Urinary Tract Infection in Childhood. Pediatr Infect Dis J. 2008;27(4):302— 308. DOI: 10.1097/INF.0b013e31815e4122.

3. Becknell B., Schober M., Korbel L., Spencer J.D. The diagnosis, evaluation and treatment of acute and recurrent pediatric urinary tract infections. Expert Rev Anti Infect Ther. 2015;13(1):81—90. DOI: 10.1586/14787210.2015.986097.

4. Palagin I.S., Sukhorukova M.V., Dekhnich A.V., Edelstein M.V., Perepanova T.S., Kozlov R.S., “DARMIS-2018” Study Group. Antimicrobial resistance of pathogens causing community-acquired urinary tract infections in Russia: results of the multicenter study «DARMIS-2018.» Clin Microbiol Antimicrob Chemother. 2019;21(2):134—146. DOI: 10.36488/cmac.2019.2.134—146.

5. Захарова И.Н., Мачнева Е.Б., Мумладзе Э.Б., Ивахненко Ю.И. Диагностика и лечение инфекций мочевых путей у детей: что нового? Медицинский совет. 2017; 1:180—185.

6. Zaman S. Bin, Hussain M.A., Nye R., Mehta V., Mamun K.T., Hossain N. A Review on Antibiotic Resistance: Alarm Bells are Ringing. Cureus. 2017; DOI: 10.7759/cureus.1403.

7. Mahony M., McMullan B., Brown J., Kennedy S.E. Multidrug-resistant organisms in urinary tract infections in children. Pediatr Nephrol. 2020; 35(9):1563—1573. DOI: 10.1007/s00467-019-04316-5.

8. Raupach T., Held J., Prokosch H.-U., Rascher W., Zierk J. Resistance to antibacterial therapy in pediatric febrile urinary tract infections—a single-center analysis. J Pediatr Urol. 2020; 16(1):71—79. DOI: 10.1016/j.jpurol.2019.10.018.

9. Demir M., Kazanasmaz H. Uropathogens and antibiotic resistance in the community and hospital-induced urinary tract infected children. J Glob Antimicrob Resist. 2020;20:68—73. DOI: 10.1016/j.jgar.2019.07.019.

10. Eltai N.O., Al Thani A.A., Al-Ansari K., Deshmukh A.S., Wehedy E., Al-Hadidi S.H., Yassine H.M. Molecular characterization of extended spectrum в-lactamases enterobacteriaceae causing lower urinary tract infection among pediatric population. Antimicrob Resist Infect Control. 2018;7(1):90. DOI: 10.1186/s13756-018-0381-6.

11. Vazouras K., Velali K., Tassiou I., Anastasiou-Katsiardani A., Athanasopoulou K., Barbouni A., Jackson C., Folgori L., Zaoutis T., Basmaci R., Hsia Y. Antibiotic treatment and antimicrobial resistance in children with urinary tract infections. J Glob Antimicrob Resist. 2020; 20:4—10. DOI: 10.1016/j.jgar.2019.06.016.

12. Wang J., He L., Sha J., Zhu H., Huang L., Zhu X., Dong J., Li G., Ge Z., Lu R., Ma G., Shi Y., Guo Y. Etiology and antimicrobial resistance patterns in pediatric urinary tract infection. Pediatr Int. 2018; 60(5):418—422. DOI: 10.1111/ped.13526.

13. Bevan E.R., Jones A.M., Hawkey P.M. Global epidemiology of CTX-M в-lactamases: temporal and geographical shifts in genotype. J Antimicrob Chemother. 2017; 72(8):2145—2155. DOI: 10.1093/jac/dkx146.

14. Rivoarilala O.L., Garin B., Andriamahery F., Collard J.M. Rapid in vitro detection of CTX-M groups 1, 2, 8, 9 resistance genes by LAMP assays. Galdiero M, editor. PLoS One. 2018; 13(7):e0200421. DOI: 10.1371/journal.pone.0200421.

15. Evans B.A., Amyes S.G.B. OXA-Lactamases. Clin Microbiol Rev. 2014; 27(2):241—263. DOI: 10.1128/CMR.00117—13.

16. Palzkill T. Metallo-e-lactamase structure and function. Ann N Y Acad Sci. 2013;1277(1):91—104. DOI: 10.1111/j.1749-6632.2012.06796.x.

17. Adam M.A., Elhag W.I. Prevalence of metallo-e-lactamase acquired genes among carbapenems susceptible and resistant Gramnegative clinical isolates using multiplex PCR, Khartoum hospitals, Khartoum Sudan. BMC Infect Dis. 2018; 18(1):668. DOI: 10.1186/s12879-018-3581-z.

18. Thänert R., Reske K.A., Hink T., Wallace M.A., Wang B., Schwartz DJ., Seiler S., Cass C., Burnham C.-A.D., Dubberke E.R., Kwon J.H., Dantas G. Comparative Genomics of Antibiotic-Resistant Uropathogens Implicates Three Routes for Recurrence of Urinary Tract Infections. Parkhill J, editor. MBio. 2019; 10(4) DOI: 10.1128/mBio.01977-19.

19. Reaffirmation of AAP Clinical Practice Guideline: The Diagnosis and Management of the Initial Urinary Tract Infection in Febrile Infants and Young Children 2—24 Months of Age. Pediatrics. 2016; 138(6):e20163026—e20163026. DOI: 10.1542/peds.2016—3026.

20. Союз педиатров России. Федеральные клинические рекомендации по оказанию медицинской помощи детям с инфекцией мочевыводящих путей. 2018:24.

21. . Shedko E.D., Lazareva A.V., Zorkin S.N., Novikova I.E., Vershinina M.G., Timoshina O.Y., Goloveshkina E.N., Fisenko A.P., Akimkin V.G. Quantitative multiplex real-time PCR as a method for detection of significant bacteriuria in children. Ross Pediatr Zhurnal. 2020; 23(5):284—290. DOI: http://dx.doi.org/10.18821/1560-9561-2020-23-5-284-290.

22. Lutter S.A., Currie M.L., Mitz L.B., Greenbaum L.A. Antibiotic Resistance Patterns in Children Hospitalized for Urinary Tract Infections. Arch Pediatr Adolesc Med. 2005; 159(10):924. DOI: 10.1001/archpedi.159.10.924.

23. Mirsoleymani S.R., Salimi M., Shareghi Brojeni M., Ranjbar M., Mehtarpoor M. Bacterial Pathogens and Antimicrobial Resistance Patterns in Pediatric Urinary Tract Infections: A Four-Year Surveillance Study (2009—2012). Int J Pediatr. 2014; 2014:1—6. DOI: 10.1155/2014/126142.

24. Bryce A., Costelloe C., Wootton M., Butler C.C., Hay A.D. Comparison of risk factors for, and prevalence of, antibiotic resistance in contaminating and pathogenic urinary Escherichia coli in children in primary care: prospective cohort study. J Antimicrob Chemother. 2018; 73(5):1359—1367. DOI: 10.1093/jac/dkx525.

25. Ahmed S.S., Shariq A., Alsalloom A.A., Babikir I.H., Alhomoud B.N. Uropathogens and their antimicrobial resistance patterns: Relationship with urinary tract infections. Int J Health Sci (Qassim). 2019; 13(2):48—55.

26. Fluit A.C., Visser M.R., Schmitz F.-J. Molecular Detection of Antimicrobial Resistance. Clin Microbiol Rev. 2001; 14(4):836—871. DOI: 10.1128/CMR.14.4.836-871.2001.

27. Satlin M.J., Lewis J.S., Weinstein M.P., Patel J., Humphries R.M., Kahlmeter G., Giske C.G., Turnidge J. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) and European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) position statements on polymyxin B and colistin clinical breakpoints. Clin Infect Dis. 2020; DOI: 10.1093/cid/ciaa121.

28. Antimicrobial susceptibility testing of colistin — problems detected with several commercially available products [Internet]. 2016. Available from: https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Warnings/Warnings_docs/Warning_-_colistin_AST.pdf