MODERNIZATION OF GENEOTIPING OF STRAINS B. PERTUSSIS
https://doi.org/10.22627/2072-8107-2013-12-1-34-36
Abstract
The new rapid molecular genotyping method was developed for studying the structure of ptxP promoter of pertussis toxin. Method is based on PCR-RFLP analysis, which allows studying the specific restriction profiles of the B. pertussis strains and allows differentiation of the strains with the ptxP structural particularities. The developed method for genotyping of strains of B. pertussis can be hhelpful when monitoring strains of the causative agent of whooping cough in system of an epidemiological surveillance over pertussis infections, allowing observation over circulating population of B.pertussis, revealing strains of the causative agent of whooping cough with high production of pertussis toxin and to watch their distribution.
About the Authors
G. A. Ivashinnikova
Moscow Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after G.N. Gabrichevsky
Russian Federation
Russian Federation
O. U. Borisova
Moscow Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after G.N. Gabrichevsky
Russian Federation
Russian Federation
A. V. Aleshkin
Moscow Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after G.N. Gabrichevsky
Russian Federation
Russian Federation
A. S. Pimenova
Moscow Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after G.N. Gabrichevsky
Russian Federation
Russian Federation
V. A. Aleshkin
Moscow Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology named after G.N. Gabrichevsky
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Analysis of Swedish Bordetella pertussis isolates with three typing methods: characterization of an epidemic lineage / Advani A., H.G.J. Van der Heide, H.O. Hallander, F.R. Mooi // J. of Microbiological Methods. — 2009. — V. 78. — P. 297 — 301.
2. Appearance of fim3 and ptxP3 –Bordetella pertussis strains in two regions of Sweden with different vaccination program / А. Advani et al // Vaccine. — 2011. — V. 29. — P. 3438 — 3442.
3. Selection and emergence of pertussis toxin promoter ptxP3 allele in the evolution of Bordetella pertussis / С. Lam et al. // Infect. Genetic Evolution. — 2012. — V. 12. — Р. 492—495.
4. Bordetella pertussis with increased pertussis toxin production associated with pertussis resurgence / F.R. Mooi F. R. et al // Emerg. Infect. Dis. — 2009. — V. 15. — P. 1206—1213.
5. Polymorphism in the pertussis toxin promoter region affecting the DNA-based diagnosis of Bordetella infection / Nygren M., Reizenstein E., Ronaghi M., Lundeberg J. // J. Clin. Microbiology — 2000. — V. 38. — P. 55 — 60.
6. Особенности коклюшной инфекции в различные периоды эпидемического процесса в г. Москве / О.Ю. Борисова и др. // Журнал эпидемиология и вакцинопрофилактика. — 2010. — №4. — С. 33 — 39.
7. Лыткина И.Н. Заболеваемость коклюшем в Москве и организация мероприятий по ее снижению / Лыткина И.Н., Г.Г. Чистякова, Н.Н. Филатов // Новости вакцинопрофилактики: Вакцинация. — 2004. — № 35. — С. 8—9.
8. Особенности эпидемического процесса коклюшной инфекции в Москве на современном этапе / Г.Г. Чистякова и др. // ЖМЭИ. — 2005. — № 5. — С. 35—40.
9. Особенности генотипической изменчивости штаммов B. pertussis, выделенных от больных коклюшем в России / Алешкин В.А, Борисова О.Ю., Гадуа Н.Т., Мазурова И.К. // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. — 2012. — № 5 (87). — Ч. 1. — С. 177 — 183.
10. Генетическая характеристика штаммов Bordetella pertussis, выделенных от больных коклюшем в России / О.Ю. Борисова и др. // Медицинский альманах. — 2012. — № 2 (21). — С. 30 — 34.
11. Динамика изменчивости основных генов патогенности штаммов В.pertussis, выделенных от больных коклюшем в Москве (1948—2005 г г.) / Мазурова И К., Борисова О.Ю., Комбарова С.Ю., Гадуа Н.Т., Алешкин В.А. // Молекулярная медицина. — 2008. — № 1. — С. 40 — 45.
12. Семенов Б.Ф., Захарова Н.С., Мазурова И.К. Подъем заболеваемости коклюшем на фоне массовой вакцинации. Гипотезы, объясняющие этот феномен // ЖМЭИ. — 2003. — № 6. — С. 70—73.
13. Современные штаммы Bordetella pertussis: молекулярная и иммунобиологическая характеристика / А.С. Шинкарев и др. // Журн. Микробиол. — 2007. — № 4. — С. 20 — 25.
14. Antigenic divergence between B.pertussis clinical isolates from Moscow, Russia, and vaccine strains / О. Borisova et al // J. Clin. And Vaccine Immunology. — 2007. — № 28. — P. 234—238.
15. Министерство здравоохр. СССР. Инструкция по бактериологическому и серологическому исследованиям при коклюше и паракоклюше. — 1984. — 23 стр.
Review
For citations:
Ivashinnikova G.A., Borisova O.U., Aleshkin A.V., Pimenova A.S., Aleshkin V.A. MODERNIZATION OF GENEOTIPING OF STRAINS B. PERTUSSIS. CHILDREN INFECTIONS. 2013;12(1):34-36. (In Russ.) https://doi.org/10.22627/2072-8107-2013-12-1-34-36
Views:
652
Email this article 