Этиологическая роль и молекулярно-генетические особенности Streptococcus pneumoniae при инфекционных заболеваниях у детей

Цель: выявление этиологической роли, исследования серотипового пейзажа и определения преобладающих генотипов (сиквенс-типов) Streptococcus pneumoniae у 459 детей, госпитализированных по поводу острого гнойного среднего отита, острого тонзиллита, внебольничной пневмонии, гнойного бактериального менингита.

Материалы и методы: Использовался культуральный (бактериологический) метод, молекулярные методы (ПЦР, секвенирование). Статистическая обработка проводилась с помощью программ Microsoft Excel 2007 и Statistica 6.0.

Результаты: S. pneumoniae был выявлен в 16,8% случаев. Преобладали серотипы 19F (39,7%) и 19A (13,2%), относящиеся к мультирезистентному клональному комплексу 320. С меньшей частотой (8,82%) встречались пневмококки 6 серогруппы (6АВ) — представители клонального комплекса 315, характеризующиеся устойчивостью к макролидам, клиндамицину и тетрациклину.

Соответствие выявленных серотипов антигенному составу пневмококковых вакцин составило от 70,6% до 88,2%. 

1. Баранов А.А., Намазова-Баранова Л.С., Брико Н.И., Лобзин Ю.В., Козлов Р.С., Костинов М.П., Королёва И.С., Рудакова А.В., Сидоренко С.В., Таточенко В.К., Харит С.Р., Федосеенко М.В., Вишнёва Е.А., Селимзянова Л.Р. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции у детей. Педиатрическая фармакология. 2018;15(3):200-211. https://doi.org/10.15690/pf.v15i3.1899

2. Brooks L.R.K., Mias G.I. Streptococcus pneumoniae's virulence and host immunity: aging, diagnostics, and prevention. Front. Immunol. 2018;9:1366. doi: 10.3389/fimmu.2018.01366

3. Общая заболеваемость детского населения России (0—14 лет) в 2018 году. Министерство здравоохранения Российской Федерации: статистические материалы. 2019; Часть IV.

4. Белошицкий Г.В., Королева И.С., Королева М.А. Эпидемиологическая2016 г. Материалы XI съезда ВНПОЭМП. Москва, 2017:329.

5. Yahiaoui R.Y., Bootsma H.J., den Heijer C.D.J., Pluister G.N., John Paget W., Spreeuwenberg P., Trzcinski K., Stobberingh E.E. Distribu¬tion of serotypes and patterns of antimicrobial resistance among commensal Streptococcus pneumoniae in nine European countries. BMC Infect Dis. 201;18(1):440. doi: 10.1186/s12879-018-3341-0

6. Ильенкова Н.А., Корецкая Н.М., Куртасова Л.М., Гуничева Н.В., Бахарева Н.В., Чикунов В.В., Степанова Л.В., Прокопцева Н.Л. Итоги научно-практической конференции для врачей педиатров «Пневмония у детей: диагностика, лечение и профилактика». Сибирское медицинское обозрение. 2014; 2:104—105. doi: 10.20333/25000136-2014-2-104-105

7. Лабораторная диагностика внебольничной пневмонии пневмококковой этиологии: Методические рекомендации МР 4.2.0114-16. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. 2017.

8. Лабораторная диагностика менингококковой инфекции и гной¬ных бактериальных менингитов: Методические указания МУК 4.2.1887-04. Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. 2005.

9. Об унификации микробиологических (бактериологических) ме¬тодов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений: Приказ МЗ СССР от 22.04.1985 г. № 535.

10. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 9.0, 2019. http://www.eucast.org.

11. bioMerieux SA. Etest Application Guide [интернет-ресурс]. https://www.biomerieux-usa.com/sites/subsidiary_us/files/supplementary_inserts_-_16273_-_b_-_en_-_eag_-_etest_application_guide-3.pdf

12. Centers for disease control and prevention. Conventional PCR de¬duction of 40 pneumococcal serotypes or serogroups. https://www.cdc.gov/streplab/downloads/pcr-oligonucleotide-primers.pdf

13. Public databases for molecular typing and microbial genome diversity. Streptococcus pneumoniae isolates database. https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_spneumoniae_isolates

14. Global optimal eBURST http://www.phyloviz.net/goeburst/#Description

15. Nagai K., Shibasaki Y., Hasegawa K., Davies T.A., Jacobs M.R., Ubukata K., Appelbaum P.C. Evaluation of PCR primers to screen for Streptococcus pneumoniae isolates and beta-lactam resistance, and to detect common macrolide resistance determinants. J Antimicrob Chemother. 2001;48(6):915—918.

16. Reinert R.R., Filimonova O.Y., Al-Lahham A., Grudinina S.A., Ilina E.N., Weigel L.M., Sidorenko S.V. Mechanisms of macrolide resistance among Streptococcus pneumoniae isolates from Russia. Antimicrob Agents Chemother. 2008;52(6):2260—2262. doi: 10.1128/AAC.01270-07

17. Poyart C., Jardy L., Quesne G., Berche P., Trieu-Cuot P. Genetic basis of antibiotic resistance in Streptococcus agalactiae strains isolated in a French hospital. Antimicrob Agents Chemother. 2003; 47(2):794—797.

18. Public databases for molecular typing and microbial genome diversity. Primers and PCR conditions for MLST of S. pneumoniae. https://pubmlst.org/spneumoniae/info/primers.shtml